饮用水像所有其他的一样，含有少量的细菌，大多是常见的，不过通常是无害的，当水流通过管道的时候，氯通常是用来防止它们生长，不过还是有一些问题是值得我们注意的。保定康达水业介绍有人可以在饮用水中检测出大肠菌群，大肠菌群是一类微生物，通常在人类和其他温暖的肠道发现温血动物，并在地表水中有。

当检测这些微生物在饮用水中，这表明地下来源受到污染，这些细菌的存在表明，致病的微生物，称为病原体，可能进入饮用水，如果不采取预防措施，饮用水将会有污染。酵母菌和病毒还会危及饮用水的质量，它们是微生物污染，通常在地表水中会发现。例如贾第鞭毛虫和隐孢子虫。贾第鞭毛虫是一种单细胞有机体，引起胃肠道症状。

隐孢子虫是一种寄生虫，被认为是人类腹泻病重要的原因之一。对于一个正常的免疫系统的疾病，可以持续几天腹泻、呕吐，甚至胃痉挛和发烧，人的免疫系统可能遭受更严重的症状，由隐孢子虫引起的，如霍乱样疾病。

饮用水中的硝酸盐可引起紫绀，降低血液的携氧能力，对于年龄在六个月的婴儿这是特别危险的。铅可以进入供水作为滤铜管道，当水流过管道，少量的铅会溶解在水中，使之成为污染，铅是一种有毒物质，能迅速吸收在人体系统，特别是那些小孩子。

军团菌是一种生长迅速的细菌，当水被保持在更长的时间内之间的温度，可吸入水蒸发时，它进入人体后与气溶胶，这种细菌可以引起一种烟道，称为庞蒂亚克热。